Le attività chirurgiche sono sempre state, dalla sua fondazione, un punto di eccellenza di Villa Margherita. Le sale operatorie della Clinica sono state il teatro (in inglese la Sala Operatoria è chiamata Operating Theatre) dei più illustri chirurghi italiani: Bracci, Monticelli, Valdoni e tanti altri.
Il Blocco Operatorio mette a disposizione dei chirurghi 4 sale monitorizzate costantemente per quanto riguarda il rispetto dei parametri di sicurezza e sterilità.
Nel Blocco Operatorio si incontrano la capacità manuale e artistica del chirurgo con le tecnologie più innovative come: le colonne per la laparoscopia 4K; i laser di ultima generazione per l’urologia e per l’oculistica; monitor per la visualizzazione delle immagini diagnostiche.
La sicurezza del paziente e la qualità delle cure sono al centro dell’assistenza: Villa Margherita aderisce al progetto “Safe Surgery Saves Lives” dell’OMS utilizzando la check-list per la sicurezza nel Blocco Operatorio.